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【视频课】转录组专题实战班

北京市计算中心(Beijing Computing Center,BCC)从2011年至今一直努力为生物医学科研人员提供生物信息相关培训班。为了更好的满足科研人员的需求,从单一课程发展为系列的生物信息专题培训,并可以根据学员需求安排调整课程,实现真正的定制化培训服务。

疫情反复的严峻考验下,大家不便面对面探讨学习工作中遇到的问题。窝在家,宅在校,学习却不宜落下。为丰富大家的学习内容,北京市计算中心特推出质优价廉的系列实战视频课,以供选择。

本期推出:转录组专题实战班。

 


课程内容

1 转录组前言概述

1.1 转录组学技术总结

1.2 转录组学二代测序建库策略及原理

1.3 转录组学分析文件类型及基础知识

1.4 转录组学前沿热点及应用案例

2 Linux基础

2.1 什么是操作系统

2.2 什么是Linux

2.3 如何使用Linux

2.4 Linux命令之文件操作

2.5 Linux命令之目录操作

2.6 Linux命令之文件查看

2.7 Linux命令之文件权限

2.8 Linux命令之vim

3 有参转录组实战

3.1 文件准备

3.2 输入文件解读

3.3 质量控制

3.4 比对与解读

3.5 定量与差异分析

3.6 突变检测与注释

4 Denovo转录组

4.1 数据准备

4.2 Denovo-质控

4.3 Denovo-数据清洗

4.4 Denovo-组装

4.5 Denovo-表达量计算

4.6 Denovo-差异基因分析

4.7 Denovo-功能注释

4.8 Denovo-鉴定编码区

5 miRNA测序与数据分析

5.1 miRNA简介、产生、作用机制等

5.2 miRNA常用数据库及分析流程

6 miRNA测序与数据分析上机实践

6.1 miRNA测序与数据分析常用软件介绍及数据准备

6.2 已知miRNA的鉴定及新miRNA的预测及结果查看

6.3 miRNA靶标预测

6.4 miRNA常见数据库

7 lncNRA数据分析实战

7.1 背景知识介绍

7.2 lncRNA的识别

7.3 靶标预测(一)

7.4 靶标预测(二)

8 10×单细胞转录组简介

8.1 10×单细胞转录组技术简介

8.2 单细胞获取及扩增技术简介

8.3 10×单细胞转录组测序原理简介

9 CellRanger介绍及使用

9.1 CellRanger简介、原理及实战

10 基于R包Seurat的10×单细胞转录组分析

10.1 数据导入、质控及标准化

10.2 数据降维、聚类、定性

10.3 总结及细胞定性常用数据库介绍

11 Loupe-Cell-Browser简单使用

11.1 简单使用1

11.2 简单使用2

报名费用

注册费:899元/人。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少100元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

羽林年卡

羽林年卡,9999元/张,可享有羽林学院知识店铺内所有生信方面“实战”类视频课程的免费观看权,以及过往两年内开班的部分“直播”类专栏课程的回放观看权(以专栏为单位,可联系工作人员选择1个专栏/年卡)。羽林年卡有效期一年(自账号开通之日起计算),限一人使用。


付费方式

手机银行、电子银行、银行转账、银行汇款(公务卡可联络解决)

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。



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