细胞图谱构建、细胞亚群分析、稀有细胞类型鉴定、肿瘤微环境、肿瘤耐药性…,单细胞转录组测序技术已成为近几年非常热门的话题之一。同时,转录组学数据泛滥的时代,如何才能找到数据中的亮点?如何深度挖掘数据中隐藏的创新点,让科研工作者掌握几种深度解析组学数据的方法?本课程一共3天,理论与实战相结合。培训内容包括单细胞制备技术、单细胞转录组分析标准流程、差异基因分析、功能富集分析、流程优化、常规转录组测序数据分析、多组学数据整合挖掘分析、SCI论文图表整理。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地
北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地
授课形式:线上直播 (理论+上机操作,每场都安排助教)
课程安排:2020年5月7-9日 上午9:30-11:30 下午:13:30-17:00
日期 | 主题 | 内容 | 备注 |
第一天 | 10X Genomics单细胞转录组测序技术 | 10X Genomics单细胞转录组测序技术简介 | 理论+ 上机操作 |
上机操作基础 | 1、R语言实操 2、Linux服务器架构及基本操作 | ||
第二天 | 单细胞转录组测序技术分析流程 (常规分析及高级分析流程介绍及深度解析) | 1、Cell ranger 质控 2、T-SNE聚类 3、如何确定细胞类群 4、如何寻找bio-marker 5、如何优化分析流程 | 理论+ 上机操作 |
第三天 | 多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路 | 1、多组学研究思路 2、基因共表达网络构建与Cytoscape展示 3、多组数据表达趋势聚类及深度解析策略 4、多种作图方式结合 (综合利用R、PPT等绘图工具拼接完成论文图片) 5、高分辨率SCI论文图片生成 6、综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片) 7、数据重复性评估 (如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、RealtimePCR结果) | 上机操作 |
注:课程以实际发生为准。
【报名费用】
注册费:3600元/人(含本次听课费、上机账号1个、资料费、证书费、考试费(如有),赠送一年内同等金额同课程体系线下班一个和线下7折班一个)。
备注:若您不方便参加线下班可将赠送的线下班换成2个线上班。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
课程结束后,可将上课期间用到的数据、PPT资料、脚本、视频等相关文档,通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上,便于您后续继续学习使用。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【包年优惠价】
按年付费,45000元/人。包括报名后1年以内所有线上+线下课程,全年免费参加;高性能计算资源基础账号1个,使用期限1年。
【付费方式】
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)
QQ号:3498448850
邮箱:bcc_peixun@163.com
张老师 18618295767(微信同号)
于老师 15621925881
【注】开课前三天会发送邮件通知;确认开课后,开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到,请及时电话咨询。